Bitki hastalıklarına yol açan yaygın ya da bilinmedik pek çok virüs türünü saptamak için geliştirilen VirusDetect, geniş ölçekte virüs haritaları çıkarmak için de kullanılacak. ABD'li araştırmacılar, tarım arazilerinin baş düşmanlarından olan virüs türlerinin saptanması için bir biyoinformatik teknolojisi geliştirdi. Bu teknoloji, yaygın virüslerden ender görülen türlere kadar pek çok mikroskobik zararlıya karşı etkili olabilecek.

BİLİNMEYEN VİRÜS TÜRLERİ ORTAYA ÇIKARILIYOR

Mikroskop, antikor ve moleküler teknikler gibi geleneksel yöntemler virüslerin genetik yapısına dair sınırlı bir veri sağlayabiliyor. Virüslerin yapısında bulunan kodlamayan RNA'ları (sRNA) tanımlamayı başaran VirusDetect ise bu sayede daha önce tanımlanmamış türlerinde saptanmasına yardımcı oluyor.

New York'ta bulunan Boyd Thompson Enstitüsü'nden Prof. Dr. Zhangjun Fei, Afrika'da yetişen tatlı patates çeşitleri üzerine yapılan çalışmanın VirusDetect'in geliştirilmesine öncü olduğunu söylüyor. Sahra altı Afrika'nın farklı bölgelerinden toplanan binin üzerinde örneğin bu yöntemle incelenmesi sonucu alışılmadık virüs türleri de dahil olmak üzere çok sayıda zararlı ortaya çıkarıldı. VirusDetect'in açık kaynak olarak ulaşılabilir kılacaklarını söyleyen Fei, "Yalnızca bir arazi ya da üründe değil; kıtasal hatta küresel düzeyde virüs dağılımı, çeşitliliği ve gelişimini araştırmak için bile VirusDetect stratejisi kullanılabilir" diye konuşuyor.